Mozzate è un comune definito dallo stato italiano frontaliere, quando è compreso nei 20 km dal confine con la Svizzera. Mozzate inoltre dista 26 km da Como, 28 km da Milano e 20 km da Varese.
Mozzate è molto ben collegata, il paese è infatti attraversato dalla Strada Provinciale 233 detta Varesina, che collega Milano con Varese, è presente l'ingresso della Pedemontana che offre un collegamento con l'aeroporto di Malpensa e con l'Autostrada A8 dei Laghi; infine in centro paese vi è la stazione delle Ferrovie Trenord sulla tratta Milano-Laveno Mombello.