A circa 1 km dal centro paese vi è l'ingresso dell'Autostrada Pedemontana che consente un collegamento sia con l'aeroporto di Malpensa che con l'Autostrada A8 dei Laghi che collega con Milano, Como e Varese.
A Mozzate è presente in centro paese la stazione Trenord sulla tratta Milano-Laveno Mombello, che permette di raggiungere in circa 30 minuti sia Milano che Varese. Da Mozzate si possono raggiungere facilmente anche i principali laghi della zona, quali il lago di Varese, di Como e una serie di piccoli laghi che consentono di fare piacevoli gite fuori porta.