Cislago è un paese situato sull'Asse della Strada Stale Varesina, a metà strada tra Varese, Milano e Como. La recente apertura della Pedemontana ha permesso di diminuire i tempi di percorrenza per raggiungere queste zone, rendendo Cislago un punto di snodo.
Il paese è inoltre servito dalla Ferrovia Trenord sul percorso Milano-Laveno Mombello.